Add BIOGRAPHY.DadPrelim substitution refrence

In diagram, change name BIOGRAPHY->BIOGRAPHY_DATA and add DadIDPrelim column

Reduce the HTML sidebar table of contents level to 2

Better docs for DATA_FILE conversion variable

Remove more code which worked around invalid primary key data in dump

This goes with commit: ea49f4a06a

New limits ("final" for the ones that exist now) based on group meeting

Update based on initial data conversion

Enforce rule that EntryDate <= DepartDate

Align community code max length with that of the code table

Testing for contiguous membership requires membership in one community

Fix syntax error

Load DadIDPrelim; adjust DadID and DadIDPub accordingly

Remove trailing newlines from file

Do not limit AnimID length, to match BIOGRAPHY

Add missing FROM clauses

Fix minimum age of parent at time of birth calculation

Cleanup data required to tidy data types, fixes problem #10

Improve description of file

These cleanups were done in the upstream data

Explain why permissions are set only on raw

Have BIOGRAPHY.DadIDPub follow the same NULL rules as DadPrelim

This change is questionable, since querying on DadIDPub would be
slightly wonky.  But we don't really anticipate queries.

Add BIOGRAPHY.DadID_Prelim column

New macro for if and only if NULL values

Better BIOGRAPHY.DadID description

Note where BIOGRAPHY.AnimIDs come from

Reword the standard "empty text" phrasings

Revert all code that changes the FOLLOW_MAP_TIME DDL statement on db load

The data still contains duplicate keys.

This reverts commit ea49f4a06ac3ef8c2aec1e8fbc0c08703bca36d7.
This reverts commit 3e206bacf3a14ed9a242e766c1b1e590104890dc.

Do not change the FOLLOW_MAP_TIME DDL statement at all

Finishes the fix made in ea49f4a06ac.

Properly pick up variables from the environment

Improve docs for create-schema target

Progress towards moving demography data into a production-like structure

Fix max lifespan constraint

Change BIOGRAPHY.AnimIDNum to allow NULL, and fix constraint

Fix column indexed

Allow spaces in Name column; align code with docs

Fix permissions

Fix comments

Convert data from the tidy to the easy schema

Fix to use command line argument

Require COMM_IDS.Name be unique

Improve hint; SokweDB has "admin"s and no real superusers

Document the "lib" schema

Fix typo

Move triggers and functions the user need not see into the "lib" schema

Do not need to remove primary key declaration, the data has been cleaned

Convert data into the tidy schema

As of now, this means cleaning up the data types of the "raw" schema
and checking that this does not discard any data.

Separate psql setup vars for different schemas

Stop if there's an error loading the db

Make executable

Change default conversion schema to "raw"

Separate file for db speed settings

Make "old" the default db for converting

System to load MS Access dump into Postgres

Use variable instead of hardcoding

Redo the table name arrow

For reasons not understood, the arrow glyph at the end of the
old arrow was rotated 90 degrees when displayed on the web page.

Configure Sphinx theme and RST figures to display SVG full-screen width

The demography er diagram

Move system-level commands into the sokwe_server repo

Document hardcoding of cluster init and provide related control variables

Fix copyright/author contact info

New command to support VPN for port forwarding to pg server

docs: added url to wikipage on build system

Providing richer resources for working with the build system that are
beyond the scope of the Make documentation.

Transaction isolation is now configured to be serializable

There are also new settings for PG 15, but it's too much of a hassle
to break these into a separate commit.  Especially since there's
no production data yet.

New az server settings removed "anon" from available shared libraries

No need to end db comments with a newline

Only look for db comments in *.rst files

Improve cluster creation docs

Must be able to assume the role to create an object owned by the role

Unless of course you're a superuser.

Improve error message when group is wrong

Fix latex doc builds

Account for empty db/schemas/*/create/ directories

There is nothing in the upload directory; temporarly comment out

Properly pass the schema to gen_func_comment_tmpl()

Avoid a stack trace when raising DuplicateError

Add an informative error message for when comment SQL can't be made

Add caution about installing db components in a piece-wise fashion

Ensure function installation into the db is before comment generation

Function signatures cannot be obtained until after functions are
put into the database.  This means that comment SQL cannot be generated
before functions go in.  Alter the big install/re-install targets to
be sure that things happen in the right order.

The user can still invoke the "installcomments" target without having
all the functions installed.  In this case comment installation fails.
It is up to the user to install things in the proper order, as with
tables and views, when invoking targets that install piecemeal.

Be consistent with PSQL_DEPENDS dependency placement

Fix install target docs

Remove <schema>/comments/ with clean-db

Document default pg host

Improve DATABASE TARGETS docs

Name the devloper's database "sokwedb_dev", not "sokwedb_copy"

Add user management commands: sokwedb-user-add, sokwedb-user-delete

Remove unnecessary program

Much improve the build system's performance

Have make cache the creation of targets that:
  Put things in the database.
    No point in connecting to the db all the time when
    we don't need to.
  Create directories.
    There are separate targets for directory creation dependencies
    so that adding to/deleting from directories themselves don't
    change the dependent timestamp.
  Create complex targets.
    Some targets build things that are too complex to easily
    test, in a later make run, that the target has been successfully
    completed.

In all the above cases the build system used to go ahead and do the
extra work. But now, gen_comments.py takes a long time to run
and it's really annoying to wait all the time.

Fix to cleanup comment sql

Fix indentation

Run comments taken from the docs through Sphinx to make the in-db text

Fix trigger RETURN statements

Better sentence

All non-html formats have the same epilog

Fix to capture comments at the end of a file

Technically, this shouldn't be necessary because the convention is to
declare the comment and then use it.  So no comment replacment text
should be at the end of the file.  But having a function makes
the code more clear and no harm in having code that always works.

Empty lines do not end indent blocks

Trigger functions must RETURN

Simplify logic

Reformat with black

Move make documentation above make db

This is necessary or making the db comments won't work, they depend
on $(HTML_RST_FILES) being defined when the comments are collected.

Directories must exist before the RST can

Put dependencies in the right order